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1دورية أكاديمية
المؤلفون: Andrew W Thompson, Harrison Wojtas, Myles Davoll, Ingo Braasch
المصدر: G3: Genes, Genomes, Genetics, Vol 12, Iss 4 (2022)
وصف الملف: electronic resource
Relation: https://doaj.org/toc/2160-1836
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2
المؤلفون: Elise Parey, Alexandra Louis, Jerome Montfort, Olivier Bouchez, Céline Roques, Carole Iampietro, Jerome Lluch, Adrien Castinel, Cécile Donnadieu, Thomas Desvignes, Christabel Floi Bucao, Elodie Jouanno, Ming Wen, Sahar Mejri, Ron Dirks, Hans Jansen, Christiaan Henkel, Wei-Jen Chen, Margot Zahm, Cédric Cabau, Christophe Klopp, Andrew W. Thompson, Marc Robinson-Rechavi, Ingo Braasch, Guillaume Lecointre, Julien Bobe, John H. Postlethwait, Camille Berthelot, Hugues Roest Crollius, Yann Guiguen
المساهمون: Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique ( GeT-PlaGe), Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), University of Oregon [Eugene], Université de Lausanne = University of Lausanne (UNIL), Swiss Institute of Bioinformatics [Lausanne] (SIB), Hunan Normal University (HNU), Florida Atlantic University [Boca Raton], Future Genomics Technologies, Universiteit Leiden, Norwegian University of Life Sciences (NMBU), National Taiwan University [Taiwan] (NTU), Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Système d'Information des GENomes des Animaux d'Elevage (SIGENAE), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRAE), Western Michigan University [Kalamazoo], Michigan State University [East Lansing], Michigan State University System, Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité (ISYEB ), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Génomique fonctionnelle comparative - Comparative functional genomics, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), This work was supported by the Agence Nationale de la Recherche, France (ANR) on the GenoFish project, 2016–2021 (grant No. ANR-16-CE12-003) to H.R.C., C.B., J.B., J.H.P., M.R.C., and Y.G., and by France Génomique National infrastructure, funded as part of 'Investissement d’avenir' program managed by ANR (grant No. ANR-10-INBS-09) to C.D. Part of the fellowship to E.P. was supported by funds from the European Union Horizon 2020 research and innovation program under Grant Agreement No 817923 (AQUA-FAANG). M.R.-R. was supported by the Swiss National Science Foundation grant 31003A_173048. J.H.P and I.B were supported by the National Institutes of Health under grant agreement No. R01OD011116. W.J.C. was supported by MOST grants No. 111-2611-M-002-025, 110-2611-M-002-013, and 108-2611-M-002-012-MY2., ANR-16-CE12-0035,GenoFish,Evolution des génes et des génomes après duplication compléte(2016), ANR-10-INBS-0009,France-Génomique,Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique(2010), European Project: 817923,H2020,H2020-EU.3.2.1.1., H2020-EU.3.2.3.1.,AQUA-FAANG(2019), DYnamique et Organisation des GENomes - Equipe de l'IBENS (DYOGEN), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Biologie - ENS Paris, Institute of Oceanography [Taipei], Plateforme Bio-Informatique - Génotoul, Université de Toulouse (UT)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRAE), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-BioInfOmics, Génétique des génomes - Genetics of Genomes (UMR 3525), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Swiss National Science Foundation grant 31003A_173048, National Institute of Health under grant agreement No R01OD011116, Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)
المصدر: Science
Science, 2023, 379 (6632), pp.572-575. ⟨10.1126/science.abq4257⟩
Science, vol. 379, no. 6632, pp. 572-575مصطلحات موضوعية: Animals, Zebrafish/genetics, Fishes/genetics, Eels/genetics, Biological Evolution, Phylogeny, Genome, Evolution, Molecular, Multidisciplinary, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.BA.ZV]Life Sciences [q-bio]/Animal biology/Vertebrate Zoology, [SDV.BID]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity
وصف الملف: application/pdf
URL الوصول: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::8e90575108b634b15872daf5d61dfd28
https://hal.inrae.fr/hal-04065839 -
3
المؤلفون: Alex Dornburg, Dustin J. Wcisel, Jeffrey A. Yoder, Lindsay Roupe-Abrams, Andrew W. Thompson, Tatsuya Ota, Ingo Braasch, Emma Ferraro, Katerina L. Zapfe
المصدر: Immunogenetics
مصطلحات موضوعية: Fish Proteins, Genetic Linkage, Lineage (evolution), Immunology, Context (language use), Article, Evolution, Molecular, Major Histocompatibility Complex, Holostei, Gene Duplication, biology.animal, Gene duplication, Immunogenetics, Genetics, Animals, Gene family, Skates, Fish, Bowfin, Phylogeny, Genome, biology, Phylogenetic tree, Vertebrate, Exons, biology.organism_classification, Immunity, Innate, Evolutionary biology, Multigene Family, Immunoglobulin Domains, Transcriptome, human activities
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4دورية أكاديمية
المؤلفون: Lucy A. Heap, Gilles C. Vanwalleghem, Andrew W. Thompson, Itia Favre-Bulle, Halina Rubinsztein-Dunlop, Ethan K. Scott
المصدر: Frontiers in Neuroanatomy, Vol 11 (2018)
مصطلحات موضوعية: zebrafish, hypothalamus, tectum, superior colliculus, SPIM (selective plane illumination microscopy), optogenetics, Neurosciences. Biological psychiatry. Neuropsychiatry, RC321-571, Human anatomy, QM1-695
وصف الملف: electronic resource
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5
المؤلفون: Tetsuya Nakamura, Alyssa Enny, Brett Racicot, Ingo Braasch, Anusha Shanabag, Andrew W. Thompson
المصدر: Developmental Dynamics. 250:1668-1682
مصطلحات موضوعية: 0301 basic medicine, Lepisosteus, Biology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, biology.animal, medicine, Animals, Phylogeny, Bone mineral, Dermal bone, Bone Development, Cartilage, Fishes, Vertebrate, biology.organism_classification, Spotted gar, Skull, 030104 developmental biology, medicine.anatomical_structure, Frontal bone, Evolutionary biology, Frontal Bone, Vertebrates, 030217 neurology & neurosurgery, Developmental Biology
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المؤلفون: Ernest G. Nolen, Madison H. Powers, Andrew W. Thompson, Brynn D. Lewis, John M. Bennett, Yuqi M. Cao
المصدر: Synlett : accounts and rapid communications in synthetic organic chemistry
مصطلحات موضوعية: chemistry.chemical_classification, Chemistry, Garner aldehyde, Aryl, Organic Chemistry, Aldehyde, Medicinal chemistry, humanities, Article, chemistry.chemical_compound, oxazolidinones, Tosyl, Stereoselectivity, Carboxylate, vinylserine, alkenyl amino acid, Alkyl, health care economics and organizations
URL الوصول: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::59c9d2509566050f4ec7741e70ec1a5b
http://europepmc.org/articles/PMC8341458 -
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المؤلفون: Ingo Braasch, Andrew W. Thompson, Myles Davoll, Harrison Wojtas
مصطلحات موضوعية: Nothobranchius furzeri, animal structures, biology, Evolutionary biology, Pearlfish, Evolutionary developmental biology, Killifish, Adaptation, biology.organism_classification, Clade, Genome, Nematolebias whitei
URL الوصول: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::9e811a6e9e1ceaffe18aa66345f504e2
https://doi.org/10.1101/2021.11.24.469934 -
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المؤلفون: Hugues Roest Crollius, Dustin J. Wcisel, Matthew P. Harris, Brett Racicot, Elise Parey, Jérôme Montfort, Solomon R. David, Quenton C. Fontenot, Kazuhiko Kawasaki, Allyse M. Ferrara, Yann Guiguen, Tatsuya Ota, Mauricio Losilla, Ingo Braasch, M. Brent Hawkins, Olivia E Fitch, Romain Feron, Andrew W. Thompson, Marine Milhes, Amy R. McCune, Qiaowei Pan, Emily Funk, Jeffrey A. Yoder, Camille Berthelot, Alex Dornburg, Alexandra Louis, Kevin L. Childs
المساهمون: Michigan State University [East Lansing], Michigan State University System, Harvard Medical School [Boston] (HMS), Boston Children's Hospital, Harvard University [Cambridge], Institut de biologie de l'ENS Paris (UMR 8197/1024) (IBENS), Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), North Carolina State University [Raleigh] (NC State), University of North Carolina System (UNC), Graduate University for Advanced Studies [Hayama] (SOKENDAI), Pennsylvania State University (Penn State), Penn State System, Cornell University [New York], University of California [Davis] (UC Davis), University of California, University of Lausanne (UNIL), Swiss Institute of Bioinformatics [Lausanne] (SIB), Université de Lausanne (UNIL), Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons (LPGP), Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique ( GeT-PlaGe), Plateforme Génome & Transcriptome (GET), Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Nicholls State University, University of North Carolina [Charlotte] (UNC), We are thankful for grant support from NIH R01OD011116 (I.B.), NSF DDIG DEB-1600920 (M.B.H.), NSF IOS-1755242 (A.D.) and NSF IOS-1755330 (J.A.Y.). Parts of this work have been supported by the Agence Nationale de la Recherche, France (ANR GenoFish project, 2016-2021, ANR-16-CE12-0035) to H.R.C., C.B., E.P., A.L. and Y.G. E.P., C.B. and H.R.C. received support under the program ‘Investissements d’Avenir’ launched by the French government and implemented by ANR with references ANR–10–LABX–54 MEMOLIFE and ANR-10-IDEX-0001-02 PSL* Université Paris. We thank F. Feng for access to Oneida Lake bowfin spawning habitats, the Bauer Core at Harvard University for sequencing fin transcriptomes and M. Gundappa (FISH & LINES) for species illustrations. Species silhouettes were obtained from http://PhyloPic.org. We are exceedingly grateful to the late J.L. Gómez-Skarmeta for his guidance on establishing ATAC-seq in holosteans., ANR-16-CE12-0035,GenoFish,Evolution des génes et des génomes après duplication compléte(2016), ANR-10-LABX-0054,MEMOLIFE,Memory in living systems: an integrated approach(2010), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Département de Biologie - ENS Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3)
المصدر: Nature Genetics
Nature Genetics, Nature Publishing Group, 2021, ⟨10.1038/s41588-021-00914-y⟩
Nature genetics, vol. 53, no. 9, pp. 1373-1384
Nature Genetics, Nature Publishing Group, 2021, 53, pp.1373-1384. ⟨10.1038/s41588-021-00914-y⟩مصطلحات موضوعية: Scale (anatomy), [SDV]Life Sciences [q-bio], Sequence assembly, Vertebrate Biology, Genome, Article, Evolution, Molecular, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, biology.animal, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], Developmental biology, Genetics, Animals, 14. Life underwater, Skates, Fish, Bowfin, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, Amia calva, 030304 developmental biology, 0303 health sciences, Phylogenetic tree, biology, Whole Genome Sequencing, Fishes, Vertebrate, Genomics, biology.organism_classification, Biological Evolution, Chromatin, Body plan, [SDV.BDD.EO]Life Sciences [q-bio]/Development Biology/Embryology and Organogenesis, Amiidae, Evolutionary biology, Zoology, 030217 neurology & neurosurgery
وصف الملف: application/pdf
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9
المؤلفون: Ingo Braasch, Andrew W. Thompson, Guillermo Ortí, Qiong Shi, Andrew I. Furness, Yu Huang, Amanda Coward Black, Federico G. Hoffmann
مصطلحات موضوعية: Transcriptome, biology, Evolutionary biology, Molecular evolution, media_common.quotation_subject, Dormancy, Killifish, Reproduction, Diapause, biology.organism_classification, Clade, Gene, media_common
URL الوصول: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::fd531fe48d5ce2a4f5c3fd2b714a2d8e
https://doi.org/10.1101/2021.08.09.455723 -
10
المؤلفون: Josane de Freitas Sousa, Sylvain Darnet, Danielson B. Amaral, Marcos Paulo Alves de Sousa, Igor Schneider, Guilherme Oliveira, Ingo Braasch, Amanda N. Cass, Patricia N. Schneider, Jamily Lorena, Eder S. Pires, Andrew W. Thompson, Marcus C. Davis, Aline Cutrim Dragalzew, Nadia B. Fröbisch, Carinne M. Costa
المصدر: Proceedings of the National Academy of Sciences. 116:15106-15115
مصطلحات موضوعية: Fish Proteins, 0106 biological sciences, Cladistia, Cyprinidae, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Fin regeneration, 03 medical and health sciences, Endoskeleton, Axolotl, Animals, Regeneration, 14. Life underwater, Phylogeny, 030304 developmental biology, Appendage, 0303 health sciences, Multidisciplinary, biology, Regeneration (biology), Fishes, Extremities, Molecular Sequence Annotation, Cichlids, biology.organism_classification, Biological Evolution, Ambystoma mexicanum, Gene Ontology, PNAS Plus, Evolutionary biology, Animal Fins, Transcriptome, Polypterus, Blastema
URL الوصول: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::63c50540f24db8f412131536c3863b92
https://doi.org/10.1073/pnas.1900475116
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