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1دورية أكاديمية
المؤلفون: Thomas Walther, Christopher M. Topham, Romain Irague, Clément Auriol, Audrey Baylac, Hélène Cordier, Clémentine Dressaire, Luce Lozano-Huguet, Nathalie Tarrat, Nelly Martineau, Marion Stodel, Yannick Malbert, Marc Maestracci, Robert Huet, Isabelle André, Magali Remaud-Siméon, Jean Marie François
المصدر: Nature Communications, Vol 8, Iss 1, Pp 1-12 (2017)
مصطلحات موضوعية: Science
وصف الملف: electronic resource
Relation: https://doaj.org/toc/2041-1723
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المؤلفون: B. David, Michel Chateau, Christopher M. Topham, M. Cot, E. Guémard, Vincent Tournier, E. Kamionka, A. Gilles, Gianluca Cioci, M. Dalibey, Elisabeth Moya-Leclair, C. Folgoas, Sophie Barbe, Alain Marty, Marie-Laure Desrousseaux, S. Gavalda, J. Nomme, Sophie Duquesne, Isabelle André, Helene Texier
المساهمون: Toulouse Biotechnology Institute (TBI), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), CRITT Bio-Industrie, Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole d'Ingénieurs de Purpan (INPT - EI Purpan), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Biopôle Clermont-Limagne, Carbios, Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)
المصدر: Nature
Nature, Nature Publishing Group, 2020, 580 (7802), pp.216-219. ⟨10.1038/s41586-020-2149-4⟩
Nature, 2020, 580 (7802), pp.216-219. ⟨10.1038/s41586-020-2149-4⟩مصطلحات موضوعية: Models, Molecular, 0301 basic medicine, [SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, Hydrolases, Phthalic Acids, 02 engineering and technology, Protein Engineering, medicine.disease_cause, Polymerization, 12. Responsible consumption, 03 medical and health sciences, Fusarium, Enzyme Stability, medicine, Recycling, Disulfides, Burkholderiales, Enzyme Assays, Multidisciplinary, Polyethylene Terephthalates, Depolymerization, Chemistry, 021001 nanoscience & nanotechnology, Pulp and paper industry, Thermobifida, Actinobacteria, Polyester, 030104 developmental biology, 13. Climate action, Ideonella sakaiensis, 0210 nano-technology, Carboxylic Ester Hydrolases, Plastics
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المؤلفون: Christopher M. Topham, Jeremy C. Smith
المصدر: Journal of computer-aided molecular design. 35(3)
مصطلحات موضوعية: Models, Molecular, Peptide Nucleic Acids, RNA, Untranslated, Pyrimidine, Stereochemistry, Stacking, Molecular Conformation, Alkenes, Crystallography, X-Ray, 01 natural sciences, chemistry.chemical_compound, 0103 physical sciences, Drug Discovery, Physical and Theoretical Chemistry, Base Pairing, Alanine, 010304 chemical physics, Peptide nucleic acid, Uracil, Hydrogen Bonding, DNA, 0104 chemical sciences, Computer Science Applications, Thymine, 010404 medicinal & biomolecular chemistry, Cross-Linking Reagents, Pyrimidines, chemistry, Nucleic acid, Nucleic Acid Conformation, Thermodynamics, Peptides, Linker
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المؤلفون: Isabelle André, Christopher M. Topham, Sophie Barbe
المساهمون: Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), We gratefully acknowledge access granted to the HPC resources of the Midi-Pyrenees Regional Computing Centre (CALMIP, Toulouse, France)., ANR-12-MONU-0015,ProtiCAD,Modèles multi-physiques et algorithmes robotiques pour la conception assistée par ordinateur de protéines(2012), French National Research Agency (ANR Project PROTICAD) [ANR-12-MONU-0015-03] Funding Text : This work was supported by the French National Research Agency (ANR Project PROTICAD, ANR-12-MONU-0015-03). We gratefully acknowledge access granted to the HPC resources of the Midi-Pyrenees Regional Computing Centre (CALMIP, Toulouse, France)., Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
المصدر: Journal of Chemical Theory and Computation
Journal of Chemical Theory and Computation, American Chemical Society, 2016, 12 (8), pp.4146-4168. ⟨10.1021/acs.jctc.6b00090⟩
Journal of Chemical Theory and Computation, 2016, 12 (8), pp.4146-4168. ⟨10.1021/acs.jctc.6b00090⟩مصطلحات موضوعية: 0301 basic medicine, Protein Folding, Protein Conformation, Globular protein, [SDV]Life Sciences [q-bio], Protein domain, Protein design, Ligands, globular-proteins, 010402 general chemistry, Polymorphism, Single Nucleotide, 01 natural sciences, Accessible surface area, Viral Proteins, 03 medical and health sciences, Superoxide Dismutase-1, Protein structure, Atom, scoring function, data-bank, Bacteriophage T4, Humans, Statistical physics, Physical and Theoretical Chemistry, Databases, Protein, knowledge-based potentials, Protein Unfolding, ligand-binding affinities, chemistry.chemical_classification, Quantitative Biology::Biomolecules, reference state improves, Function (mathematics), structure prediction, 0104 chemical sciences, Computer Science Applications, 030104 developmental biology, chemistry, Mutagenesis, mean force, Thermodynamics, Muramidase, accessible surface-area, Protein folding, Atomic physics, quasi-chemical approximation
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المؤلفون: Cláudio Remedios Frazão, Yoann Malbert, Christopher M. Topham, Jean Marie François, Thomas Walther
المساهمون: Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Molecular Forces Consulting, Toulouse White Biotechnology (TWB), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), valorization service of the 'Toulouse Transfer Technology', ANR-14-CE06-0024,SYNPATHIC,Ingénierie robuste et évolution dirigée de voies metaboliques synthétiques par intégration de la microfluidique et de la génomique(2014), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
المصدر: Biochemical Journal
Biochemical Journal, Portland Press, 2018, 475 (23), pp.3887-3901. ⟨10.1042/BCJ20180765⟩
Biochemical Journal, 2018, 475 (23), pp.3887-3901. ⟨10.1042/BCJ20180765⟩مصطلحات موضوعية: 0301 basic medicine, Models, Molecular, homosérine, [SDV.BIO]Life Sciences [q-bio]/Biotechnology, Protein Conformation, Lactate dehydrogenase A, Homoserine, malate dehydrogenase, Dehydrogenase, Reductase, Biochemistry, Malate dehydrogenase, Substrate Specificity, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, education, Butylene Glycols, Molecular Biology, chemistry.chemical_classification, education.field_of_study, Binding Sites, 030102 biochemistry & molecular biology, biology, Escherichia coli Proteins, Lactococcus lactis, Reproducibility of Results, protein engineering, Cell Biology, biology.organism_classification, ingénierie enzymatique, Turnover number, Biosynthetic Pathways, Alcohol Oxidoreductases, Butyrates, Kinetics, enzyme, 030104 developmental biology, Enzyme, chemistry, Metabolic Engineering, protéine, Mutagenesis, Site-Directed, synthetic biology, site-directed mutagenesis, escherichia coli, protein
URL الوصول: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::2d0bd00abd957dae8df1fbe14ced31a5
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01978892 -
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المؤلفون: Isabelle André, Nelly Martineau, Audrey Baylac, Clément Auriol, Magali Remaud-Simeon, Jean-Marie François, Christopher M. Topham, Romain Irague, Thomas Walther
المساهمون: Toulouse White Biotechnology (TWB), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), French National Research Agency (ANR programme d'Investissement d'Avenir, Project SYNTHACS) [ANR-10-BTBR-05-01], ANR-10-BTBR-0005,SYNTHACS,Biologie Synthétique pour la synthèse de molécules chimiques à haute valeur ajoutée à partir de ressources carbonées renouvelables(2010), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Andre, Isabelle, Remaud Simeon, Magali
المصدر: PLoS ONE
PLoS ONE, Public Library of Science, 2018, 13 (2), 15 p. ⟨10.1371/journal.pone.0193036⟩
PLoS ONE, 2018, 13 (2), 15 p. ⟨10.1371/journal.pone.0193036⟩
PLoS ONE, Vol 13, Iss 2, p e0193036 (2018)
Plos One 2 (13), 15 p.. (2018)مصطلحات موضوعية: 0301 basic medicine, Models, Molecular, enzymic activity, métabolisme du malate, Applied Microbiology, [SDV]Life Sciences [q-bio], Mutant, Malates, lcsh:Medicine, Protein Engineering, nicotinamide-adenine dinucleotide, 01 natural sciences, Biochemistry, nad, Substrate Specificity, Electricity, Catalytic Domain, Enzyme Inhibitors, lcsh:Science, Multidisciplinary, 010304 chemical physics, Kinase, Chemistry, Physics, activité enzymatique, Recombinant Proteins, Enzymes, Bioassays and Physiological Analysis, Physical Sciences, Engineering and Technology, Research Article, Biotechnology, Static Electricity, Library Screening, Research and Analysis Methods, Microbiology, Catalysis, 03 medical and health sciences, Industrial Microbiology, Electrostatics, 0103 physical sciences, Aspartate kinase, Enzyme kinetics, Aspartate Kinase, Kinase activity, Molecular Biology Techniques, Molecular Biology, Enzyme Assays, Gene Library, adénosine di phosphate, Molecular Biology Assays and Analysis Techniques, lcsh:R, Phosphotransferases, Substrate (chemistry), Biology and Life Sciences, Proteins, Genetic Variation, High-Throughput Screening Assays, Kinetics, 030104 developmental biology, adenosine pyrophosphate, Amino Acid Substitution, criblage, Enzymology, Biocatalysis, Mutagenesis, Site-Directed, lcsh:Q, NAD+ kinase, Directed Molecular Evolution, Biochemical Analysis, size grading, Pyruvate kinase, Cloning
وصف الملف: application/pdf
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المؤلفون: Christopher M. Topham, Jeremy C. Smith
المصدر: Computational Biology and Chemistry. 54:33-43
مصطلحات موضوعية: Static Electricity, Molecular Dynamics Simulation, Dihedral angle, Biochemistry, Protein Structure, Secondary, Accessible surface area, chemistry.chemical_compound, Protein structure, Structural Biology, Atom, Amino Acids, Quantitative Biology::Biomolecules, Organic Chemistry, Proteins, Hydrogen Bonding, Protein Structure, Tertiary, Bond length, Solvent, Computational Mathematics, Crystallography, chemistry, Solvents, Quantum Theory, Thermodynamics, Valence bond theory, Solvent exposure, Hydrophobic and Hydrophilic Interactions, Oligopeptides
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المؤلفون: Isabelle André, Luce Lozano-Huguet, Christopher M. Topham, Audrey Baylac, Magali Remaud-Simeon, Nathalie Tarrat, Nelly Martineau, Clément Auriol, Hélène Cordier, Marc Maestracci, Marion Stodel, Romain Irague, Clémentine Dressaire, Jean Marie François, Thomas Walther, Yannick Malbert, Robert Huet
المساهمون: Laboratoire d'Ingénierie des Systèmes Biologiques et des Procédés (LISBP), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Toulouse White Biotechnology (TWB), Surfaces, Interfaces et Nano-Objets (CEMES-SINanO), Centre d'élaboration de matériaux et d'études structurales (CEMES), Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Adisseo France SAS, ANR-10-BTBR-05-01, Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), ANR-10-BTBR-0005,SYNTHACS,Biologie Synthétique pour la synthèse de molécules chimiques à haute valeur ajoutée à partir de ressources carbonées renouvelables(2010), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Toulouse (INSA Toulouse), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Francois, Jean-Marie
المصدر: Nature Communications
Nature Communications, Nature Publishing Group, 2017, 8 (1), pp.15828. ⟨10.1038/ncomms15828⟩
Nature Communications, 2017, 8 (1), pp.15828. ⟨10.1038/ncomms15828⟩
Nature Communications, Vol 8, Iss 1, Pp 1-12 (2017)
Nature Communications (8), 12 p.. (2017)مصطلحات موضوعية: 0301 basic medicine, Models, Molecular, voie métabolique, General Physics and Astronomy, Reductase, synthon, chemistry.chemical_compound, Methionine, Malate Dehydrogenase, acide butyrique, Butylene Glycols, isobutyric acid, chemistry.chemical_classification, Multidisciplinary, Aldehyde Oxidoreductases, Butyrates, Process Engineering, Biochemistry, Metabolic Engineering, plasmide, Thermodynamics, Synthetic Biology, animal feeding, escherichia coli, Metabolic Networks and Pathways, aspartate kinase, aspartyl kinase, alimentation animale, Science, Biology, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Article, Metabolic engineering, 03 medical and health sciences, Biosynthesis, plasmid, Aspartate kinase, [SPI.GPROC]Engineering Sciences [physics]/Chemical and Process Engineering, Génie des procédés, malate, Phosphotransferases, Rational design, General Chemistry, metabolic pathway, Metabolic pathway, 030104 developmental biology, Enzyme, Glucose, chemistry, Mutagenesis, Site-Directed
وصف الملف: application/pdf
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المصدر: Protein Science. 22:1754-1765
مصطلحات موضوعية: 0303 health sciences, FoldX, biology, 010405 organic chemistry, Chemistry, Stereochemistry, Mutant, Mutagenesis, Substrate (chemistry), Active site, Protein engineering, 01 natural sciences, Biochemistry, 0104 chemical sciences, 03 medical and health sciences, Amylosucrase, Molecular evolution, biology.protein, Molecular Biology, 030304 developmental biology
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المصدر: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics. 81:1823-1839
مصطلحات موضوعية: Smith–Waterman algorithm, 0303 health sciences, Multiple sequence alignment, Computer science, 030302 biochemistry & molecular biology, Protein domain, Structural alignment, Structure space, Sequence alignment, Biochemistry, Dynamic programming, 03 medical and health sciences, Crystallography, Structural Biology, Pairwise comparison, Molecular Biology, Algorithm, 030304 developmental biology
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