المؤلفون: Oguievetskaia Ksenia, Martin-Chanas Laetitia, Vorotyntsev Artem, Doppelt-Azeroual Olivia, Brotel Xavier, Adcock Stewart A, de Brevern Alexandre G, Delfaud Francois, Moriaud Fabrice

المصدر: Journal of Cheminformatics, Vol 2, Iss Suppl 1, p P29 (2010)

مصطلحات موضوعية: Information technology, T58.5-58.64, Chemistry, QD1-999

وصف الملف: electronic resource

Relation: https://doaj.org/toc/1758-2946

URL الوصول: https://doaj.org/article/dd49051d38cd400fa2920bf98cd25a56

المؤلفون: Torchet, Rachel, Druart, Karen, Ruano, Luis Checa, Moine-Franel, Alexandra, Borges, Hélène, Doppelt-Azeroual, Olivia, Brancotte, Bryan, Mareuil, Fabien, Nilges, Michael, Ménager, Hervé, Sperandio, Olivier

المساهمون: Hub Bioinformatique et Biostatistique - Bioinformatics and Biostatistics HUB, Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département de Biologie structurale et Chimie - Department of Structural Biology and Chemistry, Institut Pasteur [Paris] (IP), none declared, This work used the computational and storage services (TARS cluster, VMHosting) provided by the IT department at Institut Pasteur, Paris. The authorswish to acknowledge in particular the help and technical advice of Eric Deveaud,Emmanuel Guichard, Thomas Me ́nard and Youssef Ghorbal (IT Department,Institut Pasteur). They also want to acknowledge the technical help of Tru Huynh(Structural Bioinformatics Unit, Institut Pasteur). They thank Jon Ison, BenjaminBardiaux and Pascal Campagne for their proofreading of the paper.Marvin JS (20.5.0, 2020, http://www.chemaxon.com) is used for drawingand displaying chemical structures in both Query mode and Contributionmode of iPPI-DB. Pipeline Pilot (server 19.1) is used to prepare the DrugBankdatabase from a SDF file prior to chemical similarity search 202 (2020), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Pasteur [Paris], Génomique métabolique (UMR 8030), Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Spectrométrie de Masse pour la Biologie – Mass Spectrometry for Biology (UTechS MSBio), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Ressources et de Recherche Technologique - Center for Technological Resources and Research (C2RT), Institut Pasteur [Paris]-Institut Pasteur [Paris], Centre de Bioinformatique, Biostatistique et Biologie Intégrative (C3BI), Etude de la dynamique des protéomes (EDyP), BioSanté (UMR BioSanté), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes (UGA), Biologie Computationnelle (ex C3BI), Bioinformatique structurale - Structural Bioinformatics, Druart, Karen

المصدر: Bioinformatics
Bioinformatics, 2021, 37 (1), pp.89-96. ⟨10.1093/bioinformatics/btaa1091⟩
Bioinformatics, Oxford University Press (OUP), 2021, 37 (1), pp.89-96. ⟨10.1093/bioinformatics/btaa1091⟩

مصطلحات موضوعية: [SDV.BIBS] Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], [INFO.INFO-DB]Computer Science [cs]/Databases [cs.DB], AcademicSubjects/SCI01060, Databases and Ontologies, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, [INFO.INFO-DB] Computer Science [cs]/Databases [cs.DB], [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Original Papers, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], [CHIM.CHEM]Chemical Sciences/Cheminformatics

وصف الملف: application/pdf

URL الوصول: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=pmid_dedup__::37489bf497363d63718305bff0bb57f8
https://hal.science/hal-03252561/file/btaa1091.pdf

المؤلفون: Oguievetskaia, Ksenia, Martin-Chanas, Laetitia, Vorotyntsev, Artem, Doppelt-Azeroual, Olivia, Brotel, Xavier, Adcock, Stewart A., de Brevern, Alexandre G., Delfaud, Francois, Moriaud, Fabrice

المصدر: Journal of Computer-Aided Molecular Design: Incorporating Perspectives in Drug Discovery and Design. August 2009 23(8):571-582

المؤلفون: R Torchet, K Druart, H Borges, H Ménager, Mareuil, Fabien, Moine-Franel, Alexandra, Doppelt-Azeroual, Olivia, Sperandio, Olivier

URL الوصول: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::3d030e77a7d0772d9ca0099fa41b3458

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المؤلفون: Doppelt-Azeroual, Olivia, Mareuil, Fabien, Deveaud, Eric, Kalaš, Matúš, Soranzo, Nicola, van den Beek, Marius, Grüning, Bjorn, Ison, Jon, Ménager, Hervé

المساهمون: Centre de Bioinformatique, Biostatistique et Biologie Intégrative (C3BI), Institut Pasteur [Paris]-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Computational Biology Unit [Bergen] (CBU), University of Bergen (UiB), Department of Informatics [Bergen] (UiB), Earlham Institute [Norwich], Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Center for Biological Systems Analysis - Zentrum für Biosystemanalyse [Freiburg] (ZBSA), Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, Department of Computer Science [Freiburg], Center for Biological Sequence Analysis [Lyngby], Technical University of Denmark [Lyngby] (DTU), ELIXIR-EXCELERATE is funded by the European Commission within the Research Infrastructures Programme of Horizon 2020 (676559)., The authors wish to thank the developers of the bio.tools registry, especially Emil Rydza and Piotr Chmura for the technical support they provided during the development of this tool. They also thank Bertrand Néron for the contribution of his technical expertise in Python., European Project: 676559,H2020,H2020-INFRADEV-1-2015-1,ELIXIR-EXCELERATE(2015), Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Danmarks Tekniske Universitet = Technical University of Denmark (DTU), Mareuil, Fabien, ELIXIR-EXCELERATE: Fast-track ELIXIR implementation and drive early user exploitation across the life-sciences. - ELIXIR-EXCELERATE - - H20202015-09-01 - 2019-08-31 - 676559 - VALID

المصدر: GigaScience
GigaScience, BioMed Central, 2017, 6 (6), pp.1-4. ⟨10.1093/gigascience/gix022⟩
GigaScience, 2017, 6 (6), pp.1-4. ⟨10.1093/gigascience/gix022⟩
Doppelt-Azeroual, O, Mareuil, F, Deveaud, E, Kalas, M, Soranzo, N, van den Beek, M, Gruening, B, Ison, J & M Enager, H E 2017, ' ReGaTE, Registration of Galaxy Tools in Elixir ' GigaScience . DOI: 10.1093/gigascience/gix022
Doppelt-Azeroual, O, Mareuil, F, Deveaud, E, Kalas, M, Soranzo, N, van den Beek, M, Gruening, B, Ison, J & Ménager, H 2017, ' ReGaTE: Registration of Galaxy Tools in Elixir ', GigaScience, vol. 6, no. 6, pp. 1-4 . https://doi.org/10.1093/gigascience/gix022

مصطلحات موضوعية: Internet, bioinformatics services, bio.tools, Computational Biology, Reproducibility of Results, Workflow, Bioinformatics services, Automation, User-Computer Interface, Galaxy, Computer Systems, Bio.Tools, Technical Note, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], Software, [INFO.INFO-BI] Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM]

وصف الملف: application/pdf

URL الوصول: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=pmid_dedup__::4feef4fa91deebfe79c03ff197a51c48
https://hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-02613125/document

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المؤلفون: Doppelt-Azeroual, Olivia

المساهمون: Dynamique des Structures et Interactions des Macromolécules Biologiques - Pôle de La Réunion (DSIMB Réunion), Biologie Intégrée du Globule Rouge (BIGR (UMR_S_1134 / U1134)), Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] (INTS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Université des Antilles (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Transfusion Sanguine [Paris] (INTS)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université de La Réunion (UR)-Université des Antilles (UA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), MEDIT SA, Start-up, Université Paris-Diderot - Paris VII, Alexandre de Brevern(alexandre.debrevern@univ-paris-diderot.fr), Doppelt-Azeroual, Olivia

المصدر: Sciences pharmaceutiques. Université Paris-Diderot-Paris VII, 2009. Français

مصطلحات موضوعية: [SDV.SP] Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences, binding site classification, propriété physico-chimique des surfaces d'interaction, comparaison de sites de liaisons, chemical property of protein surfaces, MED-SuMo, [SDV.SP]Life Sciences [q-bio]/Pharmaceutical sciences, classification de sites de liaison, approche fragmentale, binding site comparison, conception de-novo de molécules candidates, Surface Chemical Features, fragment-based approach for drug design

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URL الوصول: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=dedup_wf_001::43011c9d6cb1c8e1b33e035a82a58f81
https://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00410506/file/OliviaDoppeltAzeroual_THESE_Final.pdf

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