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Phylogenetic analysis reveals that the H5N1 avian influenza A outbreak in poultry in Ecuador in November 2022 is associated with the highly pathogenic clade 2.3.4.4b.
| العنوان: | Phylogenetic analysis reveals that the H5N1 avian influenza A outbreak in poultry in Ecuador in November 2022 is associated with the highly pathogenic clade 2.3.4.4b. |
|---|---|
| المؤلفون: | Bruno A; Instituto Nacional de Salud Pública e Investigación 'Leopoldo Izquieta-Pérez', Guayaquil, Ecuador; Universidad Agraria del Ecuador, Guayaquil, Ecuador. Electronic address: alfredobrunoc@gmail.com., Alfaro-Núñez A; Department of Clinical Biochemistry, Naestved Hospital, Naestved, Denmark; Section for Evolutionary Genomics, GLOBE Institute, University of Copenhagen, Copenhagen, Denmark., de Mora D; Instituto Nacional de Salud Pública e Investigación 'Leopoldo Izquieta-Pérez', Guayaquil, Ecuador., Armas R; Instituto Nacional de Salud Pública e Investigación 'Leopoldo Izquieta-Pérez', Guayaquil, Ecuador; Universidad Espíritu Santo, Guayaquil, Ecuador., Olmedo M; Instituto Nacional de Salud Pública e Investigación 'Leopoldo Izquieta-Pérez', Guayaquil, Ecuador., Garcés J; Instituto Nacional de Salud Pública e Investigación 'Leopoldo Izquieta-Pérez', Guayaquil, Ecuador., Vaca MS; Agencia de Regulación y Control Fito y Zoosanitario ('Agrocalidad'), Ministerio de Agricultura y Ganadería, Ecuador., De la Torre E; Agencia de Regulación y Control Fito y Zoosanitario ('Agrocalidad'), Ministerio de Agricultura y Ganadería, Ecuador., Jarrin D; Agencia de Regulación y Control Fito y Zoosanitario ('Agrocalidad'), Ministerio de Agricultura y Ganadería, Ecuador., Burbano L; Agencia de Regulación y Control Fito y Zoosanitario ('Agrocalidad'), Ministerio de Agricultura y Ganadería, Ecuador., Salas J; Agencia de Regulación y Control Fito y Zoosanitario ('Agrocalidad'), Ministerio de Agricultura y Ganadería, Ecuador., Imbacuan C; Agencia de Regulación y Control Fito y Zoosanitario ('Agrocalidad'), Ministerio de Agricultura y Ganadería, Ecuador., Chanatasig J; Agencia de Regulación y Control Fito y Zoosanitario ('Agrocalidad'), Ministerio de Agricultura y Ganadería, Ecuador., Barrionuevo M; Agencia de Regulación y Control Fito y Zoosanitario ('Agrocalidad'), Ministerio de Agricultura y Ganadería, Ecuador., Galante MC; Agencia de Regulación y Control Fito y Zoosanitario ('Agrocalidad'), Ministerio de Agricultura y Ganadería, Ecuador., Salas V; Agencia de Regulación y Control Fito y Zoosanitario ('Agrocalidad'), Ministerio de Agricultura y Ganadería, Ecuador., Goñi N; Centro Nacional de Referencia de Influenza, Departamento de Laboratorios de Salud Pública, Ministerio de Salud Pública, Montevideo, Uruguay., Cristina J; Laboratorio de Virología Molecular, Centro de Investigaciones Nucleares, Facultad de Ciencias, Universidad de la República, Montevideo, Uruguay., Domingues CS; Laboratório Federal de Defesa Agropecuária, Ministério da Agricultura e Pecuária, São Paulo, Brasil., Oliveira Montesino L; Laboratório Federal de Defesa Agropecuária, Ministério da Agricultura e Pecuária, São Paulo, Brasil., Gomes Cardoso F; Laboratório Federal de Defesa Agropecuária, Ministério da Agricultura e Pecuária, São Paulo, Brasil., Reischak D; Laboratório Federal de Defesa Agropecuária, Ministério da Agricultura e Pecuária, São Paulo, Brasil., Garcia-Bereguiain MA; One Health Research Group, Universidad de Las Américas, Quito, Ecuador. Electronic address: magbereguiain@gmail.com. |
| المصدر: | International journal of infectious diseases : IJID : official publication of the International Society for Infectious Diseases [Int J Infect Dis] 2023 Aug; Vol. 133, pp. 27-30. Date of Electronic Publication: 2023 Apr 20. |
| نوع المنشور: | Case Reports |
| اللغة: | English |
| بيانات الدورية: | Publisher: Elsevier Country of Publication: Canada NLM ID: 9610933 Publication Model: Print-Electronic Cited Medium: Internet ISSN: 1878-3511 (Electronic) Linking ISSN: 12019712 NLM ISO Abbreviation: Int J Infect Dis Subsets: MEDLINE |
| أسماء مطبوعة: | Publication: Hamilton, ON : Elsevier Original Publication: Hamilton, ON : Decker, c1996- |
| مواضيع طبية MeSH: | Influenza in Birds*/epidemiology , Influenza A Virus, H5N1 Subtype*/genetics, Humans ; Animals ; Poultry ; Phylogeny ; Ecuador/epidemiology ; Disease Outbreaks |
| مستخلص: | The ongoing H5N1 outbreak in the Americas caused by clade 2.3.4.4 is causing unprecedented impact in poultry and wild birds. In November 2022, a highly pathogenic avian influenza A outbreak was declared in poultry in Ecuador, affecting more than 1.1 million heads of poultry in two farms by February 2023. Phylogenetic analysis shows that the virus clade is 2.3.4.4b, and to the best of our knowledge, this is the first scientific publication reporting this clade in South America. Competing Interests: Declarations of competing interest The authors have no competing interests to declare. (Copyright © 2023 The Author(s). Published by Elsevier Ltd.. All rights reserved.) |
| تواريخ الأحداث: | Date Created: 20230422 Date Completed: 20230609 Latest Revision: 20230609 |
| رمز التحديث: | 20231215 |
| DOI: | 10.1016/j.ijid.2023.04.403 |
| PMID: | 37086864 |
| قاعدة البيانات: | MEDLINE |
Full Text via ClinicalKey 
Full Text Finder | تدمد: | 1878-3511 |
|---|---|
| DOI: | 10.1016/j.ijid.2023.04.403 |