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Draft genome sequence data of Cercospora kikuchii , a causal agent of Cercospora leaf blight and purple seed stain of soybeans.

التفاصيل البيبلوغرافية
العنوان: Draft genome sequence data of Cercospora kikuchii , a causal agent of Cercospora leaf blight and purple seed stain of soybeans.
المؤلفون: Sautua FJ; Universidad de Buenos Aires, Facultad de Agronomía, Cátedra de Fitopatología, Buenos Aires, Argentina., Gonzalez SA; Instituto de Biotecnología, IABIMO, CICVyA, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Hurlingham, Buenos Aires, Argentina., Doyle VP; Department of Plant Pathology and Crop Physiology, LSU AgCenter, Baton Rouge, LA, 70803, USA., Berretta MF; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Instituto de Microbiología y Zoología Agrícola (IMyZA), Centro de Investigaciones en Ciencias Veterinarias y Agronómicas (CICVyA), Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Buenos Aires, Argentina., Gordó M; Laboratorio Agrícola Río Paraná, San Pedro, Argentina., Scandiani MM; Universidad Nacional de Rosario, Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas, Centro de Referencia de Micología (CEREMIC), Rosario, Argentina., Rivarola ML; Instituto de Biotecnología, IABIMO, CICVyA, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Hurlingham, Buenos Aires, Argentina.; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina., Fernandez P; Instituto de Biotecnología, IABIMO, CICVyA, Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria, Hurlingham, Buenos Aires, Argentina.; Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET), Buenos Aires, Argentina.; Universidad Nacional de San Martín, Instituto de Investigaciones Biotecnológicas, Argentina., Carmona MA; Universidad de Buenos Aires, Facultad de Agronomía, Cátedra de Fitopatología, Buenos Aires, Argentina.
المصدر: Data in brief [Data Brief] 2019 Oct 21; Vol. 27, pp. 104693. Date of Electronic Publication: 2019 Oct 21 (Print Publication: 2019).
نوع المنشور: Journal Article
اللغة: English
بيانات الدورية: Publisher: Elsevier B.V Country of Publication: Netherlands NLM ID: 101654995 Publication Model: eCollection Cited Medium: Internet ISSN: 2352-3409 (Electronic) Linking ISSN: 23523409 NLM ISO Abbreviation: Data Brief Subsets: PubMed not MEDLINE
أسماء مطبوعة: Original Publication: [Amsterdam] : Elsevier B.V., [2014]-
مستخلص: Cercospora kikuchii (Tak. Matsumoto & Tomoy.) M.W. Gardner 1927 is an ascomycete fungal pathogen that causes Cercospora leaf blight and purple seed stain on soybean. Here, we report the first draft genome sequence and assembly of this pathogen. The C. kikuchii strain ARG_18_001 was isolated from soybean purple seed collected from San Pedro, Buenos Aires, Argentina, during the 2018 harvest. The genome was sequenced using a 2 × 150 bp paired-end method by Illumina NovaSeq 6000. The C. kikuchii protein-coding genes were predicted using FunGAP (Fungal Genome Annotation Pipeline). The draft genome assembly was 33.1 Mb in size with a GC-content of 53%. The gene prediction resulted in 14,856 gene models/14,721 protein coding genes. Genomic data of C. kikuchii presented here will be a useful resource for future studies of this pathosystem. The data can be accessed at GenBank under the accession number VTAY00000000 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/VTAY00000000.
(© 2019 The Authors.)
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فهرسة مساهمة: Keywords: Agriculture; Bioinformatics; Cercospora kikuchii; Cercospora leaf blight (CLB); Draft genome; Fungal pathogens; Next generation sequencing (NGS); Purple seed stain (PSS)
تواريخ الأحداث: Date Created: 20191114 Latest Revision: 20231019
رمز التحديث: 20231215
مُعرف محوري في PubMed: PMC6838444
DOI: 10.1016/j.dib.2019.104693
PMID: 31720340
قاعدة البيانات: MEDLINE
الوصف
تدمد:2352-3409
DOI:10.1016/j.dib.2019.104693