دورية أكاديمية
Molecular testing and analysis of disease spreading during the emergence of COVID-19 in Macaé, the Brazilian National Capital of Oil.
| العنوان: | Molecular testing and analysis of disease spreading during the emergence of COVID-19 in Macaé, the Brazilian National Capital of Oil. |
|---|---|
| المؤلفون: | Feitosa NM; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., da Costa Rodrigues B; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., Petry AC; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., Nocchi KJCV; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., de Moraes Brindeiro R; Laboratório de Virologia Molecular, Departamento de Genética, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Rio de Janeiro, 21941-902, Brazil., Zilberberg C; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., Monteiro-de-Barros C; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., Mury FB; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., de Souza-Menezes J; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., Nepomuceno-Silva JL; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., da Silva ML; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., de Medeiros MJ; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., de Souza Gestinari R; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., da Silva de Alvarenga A; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., Pozzobon APB; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., Silva CAO; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., das Graças Dos Santos D; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., Silvestre DH; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., de Sousa GF; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., de Almeida JF; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., da Silva JN; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., Brandão LM; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., de Oliveira Drummond L; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., Neto LRG; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., de Mello Carpes R; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., Dos Santos RC; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., Portal TM; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil., Tanuri A; Laboratório de Virologia Molecular, Departamento de Genética, Instituto de Biologia, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Rio de Janeiro, 21941-902, Brazil. atanuri1@gmail.com., Nunes-da-Fonseca R; Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade-NUPEM, Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), Av. São José do Barreto 764, Macaé, 27965-550, Brazil. rodrigo.nunes.da.fonseca@gmail.com. |
| المصدر: | Scientific reports [Sci Rep] 2021 Oct 11; Vol. 11 (1), pp. 20121. Date of Electronic Publication: 2021 Oct 11. |
| نوع المنشور: | Journal Article; Observational Study; Research Support, Non-U.S. Gov't |
| اللغة: | English |
| بيانات الدورية: | Publisher: Nature Publishing Group Country of Publication: England NLM ID: 101563288 Publication Model: Electronic Cited Medium: Internet ISSN: 2045-2322 (Electronic) Linking ISSN: 20452322 NLM ISO Abbreviation: Sci Rep Subsets: MEDLINE |
| أسماء مطبوعة: | Original Publication: London : Nature Publishing Group, copyright 2011- |
| مواضيع طبية MeSH: | COVID-19/*epidemiology , COVID-19 Nucleic Acid Testing/*statistics & numerical data , Pandemics/*statistics & numerical data , SARS-CoV-2/*isolation & purification, Adolescent ; Adult ; Aged ; Brazil/epidemiology ; COVID-19/diagnosis ; COVID-19/transmission ; COVID-19/virology ; Cities/epidemiology ; Cities/statistics & numerical data ; Female ; Humans ; Male ; Middle Aged ; RNA, Viral/isolation & purification ; SARS-CoV-2/genetics ; Young Adult |
| مستخلص: | The Brazilian strategy to overcome the spread of COVID-19 has been particularly criticized due to the lack of a national coordinating effort and an appropriate testing program. Here, a successful approach to control the spread of COVID-19 transmission is described by the engagement of public (university and governance) and private sectors (hospitals and oil companies) in Macaé, state of Rio de Janeiro, Brazil, a city known as the National Oil Capital. In 2020 between the 17th and 38th epidemiological week, over two percent of the 206,728 citizens were subjected to symptom analysis and RT-qPCR testing by the Federal University of Rio de Janeiro, with positive individuals being notified up to 48 h after swab collection. Geocodification and spatial cluster analysis were used to limit COVID-19 spreading in Macaé. Within the first semester after the outbreak of COVID-19 in Brazil, Macaé recorded 1.8% of fatalities associated with COVID-19 up to the 38th epidemiological week, which was at least five times lower than the state capital (10.6%). Overall, considering the successful experience of this joint effort of private and public engagement in Macaé, our data suggest that the development of a similar strategy countrywise could have contributed to a better control of the COVID-19 spread in Brazil. Quarantine decree by the local administration, comprehensive molecular testing coupled to scientific analysis of COVID-19 spreading, prevented the catastrophic consequences of the pandemic as seen in other populous cities within the state of Rio de Janeiro and elsewhere in Brazil. (© 2021. The Author(s).) |
| References: | Int J Environ Res Public Health. 2021 Jun 26;18(13):. (PMID: 34206732) Viral Immunol. 2021 Jun;34(5):330-335. (PMID: 32297828) Cad Saude Publica. 2021 Apr 07;37(3):e00277420. (PMID: 33852667) Virol J. 2019 May 27;16(1):69. (PMID: 31133031) Lancet Infect Dis. 2020 Jun;20(6):656-657. (PMID: 32199493) Cien Saude Colet. 2020 Jun;25(suppl 1):2461-2468. (PMID: 32520290) PLoS One. 2014 Mar 21;9(3):e93031. (PMID: 24658132) Science. 2020 Sep 4;369(6508):1255-1260. (PMID: 32703910) Braz J Infect Dis. 2020 Mar - Apr;24(2):180-187. (PMID: 32330437) Am J Pathol. 2020 Sep;190(9):1881-1887. (PMID: 32628931) Sci China Life Sci. 2019 Oct;62(10):1320-1331. (PMID: 31165352) Lancet Glob Health. 2020 Nov;8(11):e1390-e1398. (PMID: 32979314) Am J Trop Med Hyg. 2020 Dec;103(6):2382-2390. (PMID: 33078703) Infect Dis Ther. 2020 Sep;9(3):573-586. (PMID: 32725536) Euro Surveill. 2020 Jan;25(3):. (PMID: 31992387) Sci Rep. 2020 Oct 6;10(1):16608. (PMID: 33024174) PLoS One. 2021 Dec 15;16(12):e0260487. (PMID: 34910739) Biometrics. 1987 Sep;43(3):671-81. (PMID: 3663823) Biosci Trends. 2020 May 21;14(2):134-138. (PMID: 32188819) Cien Saude Colet. 2020 Sep;25(9):3377-3384. (PMID: 32876254) Nat Med. 2020 May;26(5):672-675. (PMID: 32296168) Lancet Infect Dis. 2020 May;20(5):565-574. (PMID: 32213337) Nature. 2020 Sep;585(7823):16-17. (PMID: 32860026) |
| معلومات مُعتمدة: | (E-26/210.176/2020) Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro; 307952/2017-7 Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico |
| المشرفين على المادة: | 0 (RNA, Viral) |
| تواريخ الأحداث: | Date Created: 20211012 Date Completed: 20211019 Latest Revision: 20230921 |
| رمز التحديث: | 20231215 |
| مُعرف محوري في PubMed: | PMC8505656 |
| DOI: | 10.1038/s41598-021-99475-7 |
| PMID: | 34635707 |
| قاعدة البيانات: | MEDLINE |
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Full Text Finder | تدمد: | 2045-2322 |
|---|---|
| DOI: | 10.1038/s41598-021-99475-7 |