دورية أكاديمية
Genetic description of VanD phenotype vanA genotype in vancomycin-resistant Enterococcus faecium isolates from a Bone Marrow Transplantation Unit.
| العنوان: | Genetic description of VanD phenotype vanA genotype in vancomycin-resistant Enterococcus faecium isolates from a Bone Marrow Transplantation Unit. |
|---|---|
| المؤلفون: | Marchi AP; Departamento de Moléstias Infecciosas E Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Av. Dr. Arnaldo 455, São Paulo, 01246-903, Brazil. marchi.ap@gmail.com.; Laboratório de Investigação Médica LIM 49, Bacteriologia E Resistência Antimicrobiana, Instituto de Medicina Tropical da FMUSP, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, 470, São Paulo, 05403-000, Brazil. marchi.ap@gmail.com., Neto LVP; Departamento de Moléstias Infecciosas E Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Av. Dr. Arnaldo 455, São Paulo, 01246-903, Brazil.; Laboratório de Investigação Médica LIM 49, Bacteriologia E Resistência Antimicrobiana, Instituto de Medicina Tropical da FMUSP, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, 470, São Paulo, 05403-000, Brazil.; Departamento de Controle de Infecção, Hospital das Clínicas da Universidade de São Paulo, Rua Dr. Ovídio Pires de Campos 225, Sala 629, São Paulo, 05403-010, Brazil., Côrtes MF; Departamento de Moléstias Infecciosas E Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Av. Dr. Arnaldo 455, São Paulo, 01246-903, Brazil.; Laboratório de Investigação Médica LIM 49, Bacteriologia E Resistência Antimicrobiana, Instituto de Medicina Tropical da FMUSP, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, 470, São Paulo, 05403-000, Brazil., de Castro Lima VAC; Departamento de Moléstias Infecciosas E Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Av. Dr. Arnaldo 455, São Paulo, 01246-903, Brazil.; Laboratório de Investigação Médica LIM 49, Bacteriologia E Resistência Antimicrobiana, Instituto de Medicina Tropical da FMUSP, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, 470, São Paulo, 05403-000, Brazil., Martins RCR; Laboratório de Investigação Médica LIM 49, Bacteriologia E Resistência Antimicrobiana, Instituto de Medicina Tropical da FMUSP, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, 470, São Paulo, 05403-000, Brazil., Franco LAM; Departamento de Moléstias Infecciosas E Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Av. Dr. Arnaldo 455, São Paulo, 01246-903, Brazil.; Laboratório de Investigação Médica LIM46, Parasitologia, Instituto de Medicina Tropical da FMUSP, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, 470, São Paulo, 05403-000, Brazil., Rossi F; Sessão de Microbiologia, Divisão de Laboratório de Laboratório Central, Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Av. Dr. Enéas de Carvalho Aguiar, 155, São Paulo, 05403-010, Brazil., Rocha V; Departamento de Hematologia, Hemoterapia E Terapia Celular, Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Av. Dr. Enéas de Carvalho Aguiar, 155, São Paulo, 05403-010, Brazil., Levin AS; Departamento de Moléstias Infecciosas E Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Av. Dr. Arnaldo 455, São Paulo, 01246-903, Brazil.; Laboratório de Investigação Médica LIM 49, Bacteriologia E Resistência Antimicrobiana, Instituto de Medicina Tropical da FMUSP, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, 470, São Paulo, 05403-000, Brazil.; Departamento de Controle de Infecção, Hospital das Clínicas da Universidade de São Paulo, Rua Dr. Ovídio Pires de Campos 225, Sala 629, São Paulo, 05403-010, Brazil., Costa SF; Departamento de Moléstias Infecciosas E Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, Av. Dr. Arnaldo 455, São Paulo, 01246-903, Brazil.; Laboratório de Investigação Médica LIM 49, Bacteriologia E Resistência Antimicrobiana, Instituto de Medicina Tropical da FMUSP, Av. Dr. Enéas Carvalho de Aguiar, 470, São Paulo, 05403-000, Brazil.; Departamento de Controle de Infecção, Hospital das Clínicas da Universidade de São Paulo, Rua Dr. Ovídio Pires de Campos 225, Sala 629, São Paulo, 05403-010, Brazil. |
| المصدر: | Brazilian journal of microbiology : [publication of the Brazilian Society for Microbiology] [Braz J Microbiol] 2022 Mar; Vol. 53 (1), pp. 245-250. Date of Electronic Publication: 2021 Oct 31. |
| نوع المنشور: | Journal Article |
| اللغة: | English |
| بيانات الدورية: | Publisher: Springer International Publishing Country of Publication: Brazil NLM ID: 101095924 Publication Model: Print-Electronic Cited Medium: Internet ISSN: 1678-4405 (Electronic) Linking ISSN: 15178382 NLM ISO Abbreviation: Braz J Microbiol Subsets: MEDLINE |
| أسماء مطبوعة: | Publication: 2019- : Switzerland, AG : Springer International Publishing Original Publication: Rio de Janeiro, RJ, Brasil : Sociedade Brasileira de Microbiologia |
| مواضيع طبية MeSH: | Enterococcus faecium*/genetics , Gram-Positive Bacterial Infections*/microbiology, Anti-Bacterial Agents/pharmacology ; Anti-Bacterial Agents/therapeutic use ; Bacterial Proteins/genetics ; Bone Marrow Transplantation ; Carbon-Oxygen Ligases/genetics ; Genotype ; Humans ; Phenotype ; Vancomycin/pharmacology ; Vancomycin Resistance |
| مستخلص: | Background: Vancomycin-resistant Enterococcus faecium (VREfm) is an important agent of hospital-acquired infection. VanA phenotype is characterized by resistance to high levels of vancomycin and teicoplanin and is encoded by the vanA gene, whereas VanD phenotype is characterized by resistance to vancomycin and susceptibility or intermediate resistance to teicoplanin; however, some isolates carry a VanD phenotype with a vanA genotype, but there are many gaps in the knowledge about the genetic mechanisms behind this pattern. Objective: To characterize the genetic structure, clonality, and mobile genetic elements of VRE isolates that display a VanD-vanA phenotype. Results: All vanA VRE-fm isolates displayed minimum inhibitory concentration (MIC) for vancomycin > 32µg/mL and intermediate or susceptible MIC range for teicoplanin (8-16µg/mL). The isolates were not clonal, and whole-genome sequencing analysis showed that they belonged to five different STs (ST478, ST412, ST792, ST896, and ST1393). The absence of some van complex genes were observed in three isolates: Ef5 lacked vanY and vanZ, Ef2 lacked vanY, and Ef9 lacked orf1 and orf2; moreover, another three isolates had inverted positions of orf1, orf2, vanR, and vanS genes. IS1542 was observed in all isolates, whereas IS1216 in only five. Moreover, presence of other hypothetical protein-encoding genes located downstream the vanZ gene were observed in six isolates. Conclusion: VRE isolates can display some phenotypes associated to vanA genotype, including VanA and VanB, as well as VanD; however, further studies are needed to understand the exact role of genetic variability, rearrangement of the transposon Tn1546, and presence of insertion elements in isolates with this profile. (© 2021. Sociedade Brasileira de Microbiologia.) |
| References: | Antimicrob Agents Chemother. 2004 Apr;48(4):1379-81. (PMID: 15047548) Antimicrob Agents Chemother. 2020 Jun 23;64(7):. (PMID: 32340989) J Antimicrob Chemother. 2020 Dec 1;75(12):3491-3500. (PMID: 32780112) J Clin Microbiol. 2005 Aug;43(8):3642-9. (PMID: 16081891) Antimicrob Agents Chemother. 2000 Dec;44(12):3444-6. (PMID: 11083656) J Clin Microbiol. 2008 Jan;46(1):136-44. (PMID: 17989188) Antimicrob Resist Infect Control. 2020 Aug 10;9(1):130. (PMID: 32778149) J Clin Microbiol. 2014 May;52(5):1501-10. (PMID: 24574290) Nature. 2011 Jul 20;475(7356):348-52. (PMID: 21776081) J Antimicrob Chemother. 2008 Apr;61(4):838-44. (PMID: 18230690) J Hosp Infect. 2018 Jul;99(3):346-355. (PMID: 29066140) J Antimicrob Chemother. 2020 Sep 1;75(9):2411-2415. (PMID: 32585683) Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2017 Feb;36(2):313-328. (PMID: 27752789) J Appl Microbiol. 2013 Oct;115(4):969-76. (PMID: 23844821) J Antimicrob Chemother. 2011 Dec;66(12):2758-62. (PMID: 21926081) J Mol Biol. 1990 Oct 5;215(3):403-10. (PMID: 2231712) Jpn J Infect Dis. 2013;66(1):1-5. (PMID: 23429076) Antimicrob Resist Infect Control. 2018 Nov 21;7:140. (PMID: 30479753) J Clin Microbiol. 2012 Apr;50(4):1355-61. (PMID: 22238442) Bioinformatics. 2011 Apr 1;27(7):1009-10. (PMID: 21278367) J Clin Microbiol. 2006 Jul;44(7):2635-7. (PMID: 16825401) |
| فهرسة مساهمة: | Keywords: Enterococcus faecium; Molecular characterization; Resistance; Whole-genome sequence |
| المشرفين على المادة: | 0 (Anti-Bacterial Agents) 0 (Bacterial Proteins) 6Q205EH1VU (Vancomycin) EC 6.1.- (Carbon-Oxygen Ligases) |
| تواريخ الأحداث: | Date Created: 20211031 Date Completed: 20220301 Latest Revision: 20221101 |
| رمز التحديث: | 20221213 |
| مُعرف محوري في PubMed: | PMC8882747 |
| DOI: | 10.1007/s42770-021-00634-9 |
| PMID: | 34718966 |
| قاعدة البيانات: | MEDLINE |
Find this article in full text from Springer Verlag. 
Full Text Finder | تدمد: | 1678-4405 |
|---|---|
| DOI: | 10.1007/s42770-021-00634-9 |