دورية أكاديمية

Characterization of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Omicron Variant Shedding and Predictors of Viral Culture Positivity on Vaccinated Healthcare Workers With Mild Coronavirus Disease 2019.

التفاصيل البيبلوغرافية
العنوان: Characterization of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Omicron Variant Shedding and Predictors of Viral Culture Positivity on Vaccinated Healthcare Workers With Mild Coronavirus Disease 2019.
المؤلفون: Luna-Muschi A; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Noguera SV; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Borges IC; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Divisião de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., De Paula AV; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Côrtes MF; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Larocca C; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Divisião de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Mari JF; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Divisião de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Guimarães LSP; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Divisião de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Torres PM; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Scaccia N; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Villas-Boas LS; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., da Silva AR; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Andrade PS; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Epidemiologia, Faculdade de Saúde Pública da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Teixeira JC; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Divisião de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Escadafal C; FIND, the Global Alliance for Diagnostics, Geneva, Switzerland., de Oliveira VF; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Divisião de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Tozetto-Mendoza TR; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Mendes-Correa MC; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Divisião de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Levin AS; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Divisião de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Sabino EC; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil., Costa SF; Instituto de Medicina Tropical, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Departamento de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.; Divisião de Moléstias Infecciosas e Parasitárias, Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazil.
المصدر: The Journal of infectious diseases [J Infect Dis] 2022 Nov 11; Vol. 226 (10), pp. 1726-1730.
نوع المنشور: Journal Article; Research Support, Non-U.S. Gov't
اللغة: English
بيانات الدورية: Publisher: Oxford University Press Country of Publication: United States NLM ID: 0413675 Publication Model: Print Cited Medium: Internet ISSN: 1537-6613 (Electronic) Linking ISSN: 00221899 NLM ISO Abbreviation: J Infect Dis Subsets: MEDLINE
أسماء مطبوعة: Publication: Jan. 2011- : Oxford : Oxford University Press
Original Publication: 1904-2010 : Chicago, IL : University of Chicago Press
مواضيع طبية MeSH: SARS-CoV-2*/genetics , COVID-19*/diagnosis, Humans ; Prospective Studies ; Health Personnel
مستخلص: In this prospective cohort of 30 vaccinated healthcare workers with mild Omicron variant infection, we evaluated viral culture, rapid antigen test (RAT), and real-time reverse-transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) of respiratory samples at days 5, 7, 10, and 14. Viral culture was positive in 46% (11/24) and 20% (6/30) of samples at days 5 and 7, respectively. RAT and RT-PCR (Ct ≤35) showed 100% negative predictive value (NPV), with positive predictive values (PPVs) of 32% and 17%, respectively, for predicting viral culture positivity. A lower RT-PCR threshold (Ct ≤24) improved culture prediction (PPV = 39%; NPV = 100%). Vaccinated persons with mild Omicron infection are potentially transmissible up to day 7. RAT and RT-PCR might be useful tools for shortening the isolation period.
Competing Interests: Potential conflicts of interest. All authors have declared no potential conflicts of interest. All authors have submitted the ICMJE Form for Disclosure of Potential Conflicts of Interest. Conflicts that the editors consider relevant to the content of the manuscript have been disclosed.
(© The Author(s) 2022. Published by Oxford University Press on behalf of Infectious Diseases Society of America. All rights reserved. For permissions, please e-mail: journals.permissions@oup.com.)
فهرسة مساهمة: Keywords: Omicron variant; RT-PCR; SARS-CoV-2; rapid antigen test; viral culture
SCR Organism: SARS-CoV-2 variants
تواريخ الأحداث: Date Created: 20220922 Date Completed: 20221114 Latest Revision: 20221215
رمز التحديث: 20231215
مُعرف محوري في PubMed: PMC9619435
DOI: 10.1093/infdis/jiac391
PMID: 36134610
قاعدة البيانات: MEDLINE
الوصف
تدمد:1537-6613
DOI:10.1093/infdis/jiac391