دورية أكاديمية
Association of microbiological factors with mortality in Escherichia coli bacteraemia presenting with sepsis/septic shock: a prospective cohort study.
| العنوان: | Association of microbiological factors with mortality in Escherichia coli bacteraemia presenting with sepsis/septic shock: a prospective cohort study. |
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| المؤلفون: | Maldonado N; Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla, Spain; Departamentos de Medicina y Microbiología, Facultad de Medicina, Universidad de Sevilla, Sevilla, Spain; Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS)/CSIC, Sevilla, Spain., López-Hernández I; Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla, Spain; Departamentos de Medicina y Microbiología, Facultad de Medicina, Universidad de Sevilla, Sevilla, Spain; Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS)/CSIC, Sevilla, Spain; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain., López-Cortés LE; Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla, Spain; Departamentos de Medicina y Microbiología, Facultad de Medicina, Universidad de Sevilla, Sevilla, Spain; Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS)/CSIC, Sevilla, Spain; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain., Martínez Pérez-Crespo PM; Unidad de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Virgen de Valme, Sevilla, Spain., Retamar-Gentil P; Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla, Spain; Departamentos de Medicina y Microbiología, Facultad de Medicina, Universidad de Sevilla, Sevilla, Spain; Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS)/CSIC, Sevilla, Spain; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain., García-Montaner A; Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla, Spain; Departamentos de Medicina y Microbiología, Facultad de Medicina, Universidad de Sevilla, Sevilla, Spain; Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS)/CSIC, Sevilla, Spain., De la Rosa Riestra S; Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla, Spain; Departamentos de Medicina y Microbiología, Facultad de Medicina, Universidad de Sevilla, Sevilla, Spain; Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS)/CSIC, Sevilla, Spain., Sousa-Domínguez A; Unidad de Enfermedades Infecciosas, Departamento de Medicina Interna, Complejo Hospitalario Universitario de Vigo, Spain., Goikoetxea J; Unidad de Enfermedades Infecciosas, Hospital Universitario de Cruces, Baracaldo, Spain., Pulido-Navazo Á; Área de Microbiología, Hospital General de Granollers, Granollers, Spain., Del Valle Ortíz M; Unidad de Cuidados Intensivos, Hospital Universitario de Burgos, Burgos, Spain., Natera-Kindelán C; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain; Unidad de Gestión Clínica de Enfermedades Infecciosas, Hospital Universitario Reina Sofía, Córdoba, Spain., Jover-Sáenz A; Unidad de Enfermedades Infecciosas, Hospital Universitario Arnau de Vilanova, Lleida, Spain., Arco-Jiménez AD; Departamento de Medicina Interna, Hospital Costa del Sol, Marbella, Spain., Armiñanzas-Castillo C; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain; Unidad de Enfermedades Infecciosas, Hospital Universitario de Marqués de Valdecilla-IDIVAL, Santander, Spain., Aller-García AI; Unidad de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Virgen de Valme, Sevilla, Spain., Fernández-Suárez J; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Central de Asturias. Oviedo, Spain. Área de Microbiología y Patología Infecciosa, Instituto de Investigación Sanitaria del Principado de Asturias (ISPA). Oviedo, Spain., Marrodán-Ciordia T; Servicio de Microbiología Clínica, Hospital Universitario de León, León, Spain., Boix-Palop L; Departamento de Enfermedades Infecciosas, Hospital Universitario Mutua Terrassa, Terrassa, Spain., Smithson-Amat A; Servicio de Urgencias, Hospital de l'Esperit Sant, Santa Coloma de Gramanet, Spain., Reguera-Iglesias JM; Unidad de Gestión Clínica de Enfermedades Infecciosas, Hospital Regional Universitario de Málaga. Instituto de Investigación Biomédica de Málaga y Plataforma en Nanomedicina (IBIMA Plataforma BIONAND), Málaga, Spain., Galán-Sánchez F; Servicio de Microbiología, Hospital Universitario Puerta del Mar, Cádiz, Spain., Bahamonde A; Departamento de Medicina Interna, Hospital Universitario El Bierzo, Ponferrada, Spain., Sánchez-Calvo JM; Unidad de Gestión Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica, Hospital Universitario de Jerez. Departamento de Biomedicina, Biotecnología y Salud Pública, Instituto de Investigación e Innovación Biomédica de Cádiz (INiBICA), Jerez de la Frontera, Spain., Gea-Lázaro I; Unidad de Enfermedades Infecciosas, Hospital Universitario de Jaén, Jaén, Spain., Pérez-Camacho I; Unidad de Medicina Tropical, Hospital Universitario Poniente-El Ejido, Almería, Spain., Reyes-Bertos A; Servicio de Microbiología, Unidad de Gestión Clínica de Laboratorio, Hospital Universitario Torrecárdenas, Almería, Spain., Becerril-Carral B; Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Punta de Europa, Algeciras, Spain., Pascual Á; Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla, Spain; Departamentos de Medicina y Microbiología, Facultad de Medicina, Universidad de Sevilla, Sevilla, Spain; Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS)/CSIC, Sevilla, Spain; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain., Rodríguez-Baño J; Unidad Clínica de Enfermedades Infecciosas y Microbiología, Hospital Universitario Virgen Macarena, Sevilla, Spain; Departamentos de Medicina y Microbiología, Facultad de Medicina, Universidad de Sevilla, Sevilla, Spain; Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBiS)/CSIC, Sevilla, Spain; Centro de Investigación Biomédica en Red en Enfermedades Infecciosas (CIBERINFEC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, Spain. Electronic address: jesusrb@us.es. |
| مؤلفون مشاركون: | PROBAC REIPI/GEIRAS-SEIMC/SAMICEI Group |
| المصدر: | Clinical microbiology and infection : the official publication of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases [Clin Microbiol Infect] 2024 Aug; Vol. 30 (8), pp. 1035-1041. Date of Electronic Publication: 2024 Apr 08. |
| نوع المنشور: | Journal Article |
| اللغة: | English |
| بيانات الدورية: | Publisher: Elsevier Country of Publication: England NLM ID: 9516420 Publication Model: Print-Electronic Cited Medium: Internet ISSN: 1469-0691 (Electronic) Linking ISSN: 1198743X NLM ISO Abbreviation: Clin Microbiol Infect Subsets: MEDLINE |
| أسماء مطبوعة: | Publication: 2015- : London : Elsevier Original Publication: Paris : Decker Europe, c1995- |
| مواضيع طبية MeSH: | Escherichia coli Infections*/microbiology , Escherichia coli Infections*/mortality , Bacteremia*/microbiology , Bacteremia*/mortality , Escherichia coli*/genetics , Escherichia coli*/isolation & purification , Escherichia coli*/pathogenicity , Escherichia coli*/classification , Shock, Septic*/microbiology , Shock, Septic*/mortality, Humans ; Male ; Prospective Studies ; Aged ; Female ; Middle Aged ; Aged, 80 and over ; Spain/epidemiology ; Whole Genome Sequencing ; Sepsis/microbiology ; Sepsis/mortality ; ROC Curve ; Anti-Bacterial Agents/therapeutic use ; Anti-Bacterial Agents/pharmacology ; Virulence ; Virulence Factors/genetics |
| مستخلص: | Objectives: This study aimed to determine the association of Escherichia coli microbiological factors with 30-day mortality in patients with bloodstream infection (BSI) presenting with a dysregulated response to infection (i.e. sepsis or septic shock). Methods: Whole-genome sequencing was performed on 224 E coli isolates of patients with sepsis/septic shock, from 22 Spanish hospitals. Phylogroup, sequence type, virulence, antibiotic resistance, and pathogenicity islands were assessed. A multivariable model for 30-day mortality including clinical and epidemiological variables was built, to which microbiological variables were hierarchically added. The predictive capacity of the models was estimated by the area under the receiver operating characteristic curve (AUROC) with 95% confidence intervals (CI). Results: Mortality at day 30 was 31% (69 patients). The clinical model for mortality included (adjusted OR; 95% CI) age (1.04; 1.02-1.07), Charlson index ≥3 (1.78; 0.95-3.32), urinary BSI source (0.30; 0.16-0.57), and active empirical treatment (0.36; 0.11-1.14) with an AUROC of 0.73 (95% CI, 0.67-0.80). Addition of microbiological factors selected clone ST95 (3.64; 0.94-14.04), eilA gene (2.62; 1.14-6.02), and astA gene (2.39; 0.87-6.59) as associated with mortality, with an AUROC of 0.76 (0.69-0.82). Discussion: Despite having a modest overall contribution, some microbiological factors were associated with increased odds of death and deserve to be studied as potential therapeutic or preventive targets. (Copyright © 2024 The Authors. Published by Elsevier Ltd.. All rights reserved.) |
| فهرسة مساهمة: | Keywords: Escherichia coli; Mortality; Sepsis; Septic shock; Virulence; Whole-genome sequencing |
| المشرفين على المادة: | 0 (Anti-Bacterial Agents) 0 (Virulence Factors) |
| تواريخ الأحداث: | Date Created: 20240410 Date Completed: 20240717 Latest Revision: 20240717 |
| رمز التحديث: | 20240718 |
| DOI: | 10.1016/j.cmi.2024.04.001 |
| PMID: | 38599464 |
| قاعدة البيانات: | MEDLINE |
| تدمد: | 1469-0691 |
|---|---|
| DOI: | 10.1016/j.cmi.2024.04.001 |