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La diversidad y dinámica de comunidades microbianas ante cambios ambientales y nutricionales, así como las relaciones metabólicas que se es-tablecen resultan de especial interés para entender el funcionamiento de los ecosistemas. En este trabajo se describen las principales técnicas mole-culares utilizadas para determinar la estructura, diversidad, dinámica, o la identificación microbiana en una muestra ambiental, ya sea de un ambiente natural (suelo agrícola) o de un ambiente construido (digestor anaerobio). Además, se proponen estrategias de combinación de métodos moleculares bajo enfoque polifásico basado en experiencias exitosas. Teniendo en consi-deración las comunidades de diversas bacterias, arqueas y hongos que habi-tan los ambientes citados, se proponen desde los cebadores a utilizar para aislar genes consevados, las secuencias de sondas de ADN marcadas, hasta las combinaciones de técnicas utilizables para caraterizar una comunidad microbiana bajo enfoque polifásico, según su dinámica, diversidad, cuantifi-cación e identificación. Las técnicas metagenómicas clásicas y de última generación constituyen herramientas poderosas para monitorear muestras ambientales, con un costo beneficio aceptable para países como Cuba. |
