Como consecuencia de las masivas corrientes migratorias de origen europeo que arribaron a la ciudad de Buenos Aires, las frecuencias génicas de los sistemas ABO y Rh en muestras hospitalarias de las décadas de 1930 y 1940 eran similares a las registradas en España e Italia. A partir de los años cuarenta, poblaciones del interior del país y de países limítrofes, de elevada composición indígena y posiblemente también africana, migraron hacia la ciudad. Para evaluar su repercusión sobre la estructura genética de la población nos propusimos analizar muestras poblacionales actuales. Los estudios se realizaron sobre dos muestras del Banco de Sangre del Hospital Italiano denominadas MI y MII. La MI comprendió la información del Registro de Dadores de Sangre de esa unidad, para los sistemas ABO y Rh (D) (N=13.217). Para la MII se analizaron 9 sistemas eritrocitarios y los alotipos GM/KM (N=202). En este último caso se realizó una encuesta con la finalidad de obtener información sobre lugar de nacimiento, residencia actual y datos genealógicos. Las frecuencias génicas se determinaron empleando métodos de máxima verosimilitud. El mestizaje se estimó aplicando el programa ADMIX (trihíbrido). Las frecuencias génicas obtenidas para ABO y Rh difieren significativamente de las detectadas antes de mitad del siglo. Se registró 10.5% de aporte aborigen en la MI y 15.9% en la MII, mientras que sólo se detectó la presencia de componente africano en una región de la MI (1.0%) y en la MII (3.3%). Estos resultados, que confirmarían la existencia de cambios en la composición genética de la población de la ciudad de Buenos Aires, se discuten en referencia a la información demográfica e histórica.