Los microsatélites son marcadores moleculares ampliamenteutilizados en estudios de biodiversidad, siendo particularmenteútiles en la identificación varietal. Otra de las aplicaciones másrecientes de los microsatélites se halla en el campo de laagroalimentación, siendo una herramienta útil en el desarrollo desistemas de trazabilidad y autentificación. La comparación desecuencias y genomas (genómica comparativa) ha permitidorecientemente desarrollar nuevas herramientas como lospolimorfismos de un solo nucleótido (SNP; del inglés, “SingleNucleotide Polymorphisms”) e inserciones/deleciones (del inglés,“indels”), que completan la cobertura genómica de los microsatélites.Los principales objetivos de esta tesis son el uso y evaluación de: i)marcadores microsatélite basados en secuencias nucleares, comoherramientas en el estudio y caracterización de la agrodiversidad, enespecies olvidadas e infrautilizadas (cultivos prometedores), como lahiguera; y ii) marcadores microsatélite e inserciones/delecionesbasados en la comparación de genomas de cloroplastos de olivo,para la identificación varietal y la aplicabilidad de ellos a latrazabilidad de los aceites de oliva de distintas variedades. Losresultados han demostrado que se trata de herramientas eficaces enla caracterización de este germoplasma local, poniendo demanifiesto la gran variabilidad que éste alberga. Todo ello hapermitido identificar variedades de olivo, tanto a partir de hoja comode aceite. Algunos de los haplotipos identificados pueden serempleados en la trazabilidad del aceite de oliva.
الوصف (مترجم):
Microsatellites are molecular markers widely used for biodiversitystudies, being particularly useful in varietal identification. A morerecent application of these markers is in the agrifood field, being asuitable tool for the development of authentication and traceabilitysystems. Comparisons of sequences and genomes (comparativegenomics) have recently allowed the development of new tools, suchas single nucleotide polymorphisms (SNP) and insertions/deletions(indels), which complete the genomic coverage of microsatellites.The main goals of the present thesis are the use and evaluation of: i)nuclear sequence-based microsatellite markers, as a tool for thestudy and characterization of the agrodiversity in neglected andunderutilized species (promising crops), such as the fig tree; and ii)microsatellite and indel markers, based on comparisons of genomechloroplast of the olive tree, for varietal identification and theirapplication to the traceability of olive oils from different varieties.Nuclear sequence-based microsatellite markers have been selectedto evaluate the germplasm agrodiversity in fig tree. The presence ofunique alleles has allowed the discrimination amongst localpopulations. The results have demonstrated that these markers areeffective tools in the characterization of this local germplasm,revealing a high level of variability. All this has allowed theidentification of olive tree varieties, both from the leaves and fromthe olive oils. Some haplotypes could be used for olive-oiltraceability purposes.
