Besides classic enteric viruses such hepatitis A virus and norovirus, there are other viruses that can reach water sources without being part of their transmission route. Some of these pathogens are enveloped viruses, which complicates their recovery with the usual concentration methods for the classic naked enteric viruses. Glass wool filtration followed by polyethylene glycol (PEG) 6000 precipitation is cheap and reliable for recovering non-enveloped viruses, but is inefficient for the concentration of enveloped viruses. Thus, the first goal of this Thesis was the optimization of the glass wool filtration method for the recovery of enveloped viruses without losing efficiency for the recovery of naked viruses. Once optimized, this protocol was used to concentrate viruses from multiple water types such drinking water, surface water, well water, wastewater and brackish pond water. The results presented suggest that the optimized glass wool filtration method is useful and reliable for recovering both enveloped and non-enveloped viruses. Of particular interest was the characterization of a norovirus outbreak of gastroenteritis associated to the consumption of bottled water. Remarkably, several emerging viruses, such as non- classical astroviruses, West Nile virus and rat coronaviruses, were detected in samples from Riyadh (Saudi Arabia), and Barcelona. Additionally, a monthly surveillance of enterovirus in the Barcelona wastewater was implemented for the control of the circulation of highly pathogenic species such as Enterovirus A71 and D68. The dominant consensus sequence and the ensemble of major and minor sequences were determined by Sanger and deep sequencing, respectively.
ADVERTIMENT. Tots els drets reservats. L'accés als continguts d'aquesta tesi doctoral i la seva utilització ha de respectar els drets de la persona autora. Pot ser utilitzada per a consulta o estudi personal, així com en activitats o materials d'investigació i docència en els termes establerts a l'art. 32 del Text Refós de la Llei de Propietat Intel·lectual (RDL 1/1996). Per altres utilitzacions es requereix l'autorització prèvia i expressa de la persona autora. En qualsevol cas, en la utilització dels seus continguts caldrà indicar de forma clara el nom i cognoms de la persona autora i el títol de la tesi doctoral. No s'autoritza la seva reproducció o altres formes d'explotació efectuades amb finalitats de lucre ni la seva comunicació pública des d'un lloc aliè al servei TDX. Tampoc s'autoritza la presentació del seu contingut en una finestra o marc aliè a TDX (framing). Aquesta reserva de drets afecta tant als continguts de la tesi com als seus resums i índexs.
